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我院与合作单位共同揭示急性脑卒中DNA甲基化表观遗传修饰谱

发布时间:2019-05-17 浏览量:779

 2019年5月14日,上海市第八人民医院、上海交通大学附属第六人民医院徐汇分院神经内科陈旭主任团队联合同济大学附属东方医院周代占研究组、上海交通大学bio-x研究院贺林院士团队及浦东新区人民医院神经内科白青科主任在国际知名专业学术期刊《Stroke》杂志在线发表题为“Epigenome-wide association study indicates hypomethylation of MTRNR2L8 inlarge-artery atherosclerosis stroke”的文章。该研究从全基因组甲基化层面揭示了急性脑卒中患者的表观遗传修饰图谱,鉴定到MTRNR2L8基因显著的低甲基化是急性脑卒中患者的关键的分子标记,为未来脑卒中的早期筛查及靶向分子治疗提供了一种新的解决方案。

我国是全世界脑卒中发病率最高的国家之一。目前,脑卒中也是我国居民死亡的第一位原因,是生命健康的第一杀手。我国每年约有200余万新发脑卒中患者,其中85%左右为缺血性脑卒中。缺血脑卒中俗称“脑梗”,其急性发作的时间窗较短,如若无及时诊治,则极大地提高了脑卒中的致残(偏瘫,失语等)和死亡风险。因此,脑卒中的预防需要提高脑卒中筛查的有效性,将疾病控制在脑卒中的急性发作期之前,但目前血液生化指标仅能评估脑卒中的高危风险,尚无有效的筛查分子标志物。

以往研究表明,DNA甲基化变化是疾病发生早期和进展过程中主要的特征之一,同时也是疾病治疗疗效的潜在影响因素之一。通过检测血液中DNA甲基化水平,可以对疾病的进行筛查、诊断和个体化治疗。基于以上依据,项目合作组的沈玉佩、彭晨运用全基因组DNA甲基化EWAS技术,在12对年龄、性别匹配的病例-对照样本,筛选出672个基因上的1012个CpG位点在脑卒中患者中发生了甲基化的显著差异,从而全面地揭示了脑卒中的DNA甲基化表观遗传修饰图谱。

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图1,急性脑卒中EWGS研究

研究组进一步运用SequenomEpiTYPER技术通过“两步验证”法首次发现MTRNR2L8 基因启动子区低甲基化和脑梗发生显著相关(P=8.86×10-14)。MTRNR2L8 基因甲基化对脑卒中具有高度的特异性和灵敏性,是脑卒中分子筛查的潜在标记物。基于先前国外其他研究,MTRNR2L8基因所翻译的多肽分子还与脑卒中的治疗相关,因此MTRNR2L8基因甲基化为脑卒中早期筛查和治疗提供了新途径,基于该项研究的后续研究已经开展。

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图2,MTRNR2L8基因在脑卒中患者中的甲基化差异及临床意义

该工作得到了国家自然科学基金委,上海市科技技术委员会,徐汇区卫生健康委员会的相关资助。